中医药学院创建于1978年，是北京市属唯一一所培养高级中医药人才的院校，2002年进入首都医科大学，成为其二级学院。学院现设二系一中心：即中医学系、中药学系及教学科研实验中心。

　　学院现有研究生、本科生、成人高等教育等多种办学层次。同时拥有中医学、中药学两个一级学科硕士学位授权点。在中医临床基础、中医医史文献、中医诊断学、方剂学及中药学方向招收研究生。本科教育设有中医学及中药学2个专业。本科教育的任务是发展中医药专业精品教育，提高招生质量，实行导师制，在中医传承培养方面具有特色。学院现有学生600余人，教职工67人，其中正副教授、正副主任医师、讲师等专职教师50人，教师中博士14人，在读博士4人。拥有一支结构合理、实力雄厚的师资队伍，并拥有高益民、李广钧、周跃庭、钱英、杨宝琴、高忠英等一批国家级名老中医，为北京市及全国培养高质量实用型的中医药高级专门人才。20多年来，已为北京地区培养输送了毕业生2000余人，其中大多数已成为中医药行业的骨干。

　　学院十分重视中医药学科建设和科研工作。在中医学、中药学二个一级学科中确定中医临床基础学为优势学科，中医医史文献学科为特色学科，中药制药学为重点建设学科，临床中药学为重点扶持学科，其他均为教育必需学科。并制定了以“一优一特一重点一重点扶持”4个二级学科建设为重点的学科发展战略，同时在教育必需学科建设中全面推进二级学科的建设，突出中医与中药紧密结合、基础与临床紧密结合的中医药学科特色。中医临床基础学科以经典理论（仲景、温病学说）指导临床证治研究为切入点，加强基础与临床的合作，开展中医药防治肝病、代谢性疾病、老年病的研究，在病毒性肝炎、抗肝纤维化、脂肪肝防治等方面取得成果。中医医史文献学科从语言的视角对中医文献的语言规律、特点以及在医学理论发展中的地位、作用进行整理研究，已完成中国古代医学要籍中重言的研究，并完成了中医症状语言数据库、消渴古籍网络等多个数据库的建设，目前正利用学校图书馆资源，深入开展文献数字客观化的研究工作。中药制药学科利用流体声能等新技术，对传统中药剂型进行改造，在提取、精制、成型、增加稳定性等方面进行应用评价和推广研究。经过长期不懈的努力，学院先后获卫生部、国家中医药管理局、市科委、市卫生局科技进步成果奖20余项。目前承担国家级、市局级课题20余项，另外学院还通过重点学科建设项目及专项经费等多渠道筹集资金，使学科建设扎扎实实地推进。

　　近年来，学院广泛开展对外交流，许多国家和地区的学者、专家来学院参观访问，并先后与日本、美国、加拿大、巴西、以色列、台湾、香港等国家和地区的教学、医疗单位建立了友好合作关系，学院也多次派专家、学者出国参观讲学，为弘扬中国中医药文化而不懈努力。目前全院师生正以饱满的热情团结一致，锐意进取，积极探索，立志建立一流的中医药学院，为实现首都医科大学的“国内一流，国际知名”的目标而努力奋斗。