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2018年宁波大学3824生物信息学考博大纲
第 1 页,共 2 页2018 年宁波大学博士研究生招生考试初试科目考 试 大 纲科目代码、名称: 3824 生物信息学一、考试形式与试卷结构(一)试卷满分值及考试时间本试卷满分为 100 分,考试时间为 180 分钟。(二)答题方式答题方式为闭卷、笔试。试卷由试题和答题纸组成;答案必须写在答题纸(由考点提供)相应的位置上。(三)试卷内容结构考试内容包括生物信息学概况,常用生物医学数据库,常用生物信息学算法,组学数据的注释与分析如蛋白质组、转录组、表观遗传组及基因组,基因表达与调控网络。(四)试卷题型结构1.名词解释2.选择题3.简答题4.案例分析题二、考查目标课程考试的目的在于测试考生对于生物信息学的基本概念、基本理论、基础知识的掌握程度以及综合运用分析和解决实际问题的能力。三、考查范围或考试内容概要第一部分 生物信息学概况1.生物信息学基本概念、研究方向、发展历史和趋势。第二部分 常用生物信息学数据库1. 生命信息流各层面上(DNA、RNA、蛋白质等)的经典数据库、整合数据库;2. 新生数据库,如核酸和蛋白质结构与功能注释、调节关系数据库、癌症相关数据库等。第 2 页,共 2 页第三部分 常用生物信息学算法1. 序列比对,蛋白和核酸双序列比对、多序列比对基本算法和工具;2. 分子进化分析方法、进化树的构建;保守性位点分析等。第四部分 组学数据的注释与分析1. 基因组测序基本方法,基因组拼接和注释流程,常用工具;2. 转录组测序方案,转录组数据分析思路,流程及工常用具;3. 表观遗传组数据分析流程;4. 蛋白质组数据的分析方法和注释。第五部分 基因表达与调控网络1. 差异表达分析;2. 基因功能富集分析;3. 常用基因调节关系或相互作用的数据库;4. 常用基因网络模块挖掘工具及网络视图软件。参考教材或主要参考书:1. 李霞,雷健波主编,生物信息学(第2版/八年制),人民卫生出版社,2015.6;2. 陈铭主编,生物信息学(第2版),科学出版社,2015.2;