2019年宁波大学3824生物信息学博士研究生考试大纲考博大纲

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2019 年宁波大学博士研究生招生考试初试科目
考 试 大 纲
科目代码、名称: 3824 生物信息学
一、考试形式与试卷结构
（一）试卷满分值及考试时间
本试卷满分为 100 分，考试时间为 180 分钟。
（二）答题方式
答题方式为闭卷、笔试。试卷由试题和答题纸组成；答案必须写在答题纸（由考点提供）
相应的位置上。
（三）试卷内容结构
考试内容包括生物信息学概况，常用生物医学数据库，常用生物信息学算法，组学数据
的注释与分析如蛋白质组、转录组、表观遗传组及基因组，基因表达与调控网络。
（四）试卷题型结构
1.名词解释
2.选择题
3.简答题
4.案例分析题
二、考查目标
课程考试的目的在于测试考生对于生物信息学的基本概念、基本理论、基础知识的掌握
程度以及综合运用分析和解决实际问题的能力。
三、考查范围或考试内容概要
第一部分 生物信息学概况
1.生物信息学基本概念、研究方向、发展历史和趋势。
第二部分 常用生物信息学数据库
1. 生命信息流各层面上（DNA、RNA、蛋白质等）的经典数据库、整合数据库；
2. 新生数据库，如核酸和蛋白质结构与功能注释、调节关系数据库、癌症相关数据库等。
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第三部分 常用生物信息学算法
1. 序列比对，蛋白和核酸双序列比对、多序列比对基本算法和工具；
2. 分子进化分析方法、进化树的构建；保守性位点分析等。
第四部分 组学数据的注释与分析
1. 基因组测序基本方法，基因组拼接和注释流程，常用工具；
2. 转录组测序方案，转录组数据分析思路，流程及工常用具；
3. 表观遗传组数据分析流程；
4. 蛋白质组数据的分析方法和注释。
第五部分 基因表达与调控网络
1. 差异表达分析；
2. 基因功能富集分析；
3. 常用基因调节关系或相互作用的数据库；
4. 常用基因网络模块挖掘工具及网络视图软件。
参考教材或主要参考书：
1. 李霞，雷健波主编，生物信息学（第2版/八年制），人民卫生出版社，2015.6；
2. 陈铭主编，生物信息学（第2版），科学出版社，2015.2；