生态学、环境科学、地图学与地理信息系统均是我所优势学科研究领域，并被我所列为今后重点发展的学科领域。我所自上世纪70年代起就开始从事生态学和环境科学研究，是国内最早开展土壤生态、农业生态和土壤环境保护研究的单位之一。几十年来无论在土壤生态学和农业生态学领域还是在土壤环境科学领域，我所的研究水平及研究成果一直处于国内领先地位，并在国际上产生较大的影响。其中农田生态系统养分循环和土壤生态领域数理建模，大型水利工程对长江流域土壤生态系统影响以及黄淮海平原农业生态建设、红壤退化生态系统恢复重建、全国土壤环境背景值调查和环境容量研究、农业面源污染及其控制对策研究、土壤重金属及农药污染的研究均获得国家和部省级的多次科技奖励。地图制图与地理遥感信息技术的研究与应用也是我所在土壤学研究中的重要研究领域之一。自上世纪80年代以来，我所主持编制《1：400万中华人民共和国土壤图》、《中国土壤图集》和参与编制《中华人民共和国国家农业地图集》均得到国家和中国科学院的奖励。我所还大量运用GIS和遥感技术，完成了全国1：400万系列数据库和全国土壤退化图编制、华东片安徽、江西的资源快速调查和1：25制图、浙、闽、台三省3个时段1：10万土地利用及其变化研究等工作。近年来还率先引进SOTER数据库的研究方法，先后在海南、山东、四川、辽宁和苏南等地区进行了相关研究，在亚洲起到了示范作用。

　　随着新培养专业的增列，我所研究生培养的专业范围将得到进一步的扩大，报考生源也将更加趋于多元化，这势必为我所的人才培养工程和知识创新工程注入了新的活力。