浙大人文学院教授张涌泉指导的博士生张小艳的学位论文“敦煌书仪语言研究”，机能学院岑可法院士指导的博士生周昊的学位论文“大型电站锅炉氮氧化物控制和燃烧优化中若干关键性问题的研究”，环资学院教授朱利中指导的博士生陈宝梁的学位论文“表面活性剂在土壤有机污染修复中的作用及机理”，农学院教授喻景权指导的博士生周艳虹的学位论文“低温对黄瓜光合机构光能吸收、电子流分配和CO2同化的影响及其调控机制”，农学院教授周雪平指导的博士生崔晓峰的学位论文“双生病毒DNAb分子bC1基因的功能研究”等5篇论文入选2006年全国优秀博士学位论文。

　　此外，浙大万秋红、余学功、张军明、吴建国、汪以真、朱永良和何贵兵等7位博士的学位论文入选全国优秀博士学位论文提名论文。