随着2005新学年的到来，中山大学研究生院出台新规定，从2006年开始，将生命科学学院等部分院系的硕士生学习年限，从原来的“两年制”重新改回“三年制”。这是自03年中山大学对硕士生专业实行“两年制”改革以来，首次进行的“逆向调整”。
据了解，此次重新从“两年制”调整为“三年制”的主要是生命科学学院和地球科学系的相关硕士点，这在整个中大200多个硕士点中占10％左右。对此，中山大学研究生院副院长周云表示，中山大学对研究生学制改革秉承的是“全面铺开，有所保留”的原则，因此这次调整是个别院系根据学科建设、毕业走向等多种具体情况做出的，应被视为大学研究生学制改革中应有的探索，不意味着对“两年制”改革的否定。
中山大学03年出台《中山大学硕士研究生培养工作试行办法》，规定除专业学位点和部分有特殊要求的学科外，在所有学科中试行新的硕士研究生培养制度。中山大学校园网的相关网页上还有这样一句话：“今后，二年制将作为我校培养攻读硕士学位研究生的主导学制”。
对于此次部分专业年限调整的原因，生命科学学院研究生工作部有关负责人表示，自03年改革以来，实际证明“两年制”对于该院硕士生的培养并不能完全匹配。首先，由于理科硕士生的学习以研究型为主，特别注重实验。在第一年的基本学分修完之后，实验周期的长短很大程度上决定了学习年限。据
统计，在实行“三年制”时，生命科学学院能够按期毕业的硕士生也只占到全部学生的一半左右，剩下的都是因实验周期长而导致的延期毕业。
“因此如果完全按两年制，有些以水稻栽培、鳗鱼养殖为实验的专业，连水稻和鳗鱼生长所需的时间都不够，更别说接下来的实验分析、论文写作了，”该负责人强调，“做学问不能人为设定时间限制”。
此外，某些单位尤其是科研性单位在招收相关毕业生时，也特别表现出对“三年制”的青睐，这也是导致部分专业重返“三年制”的重要原因之一。记者了解到，今年是03年首批“两年制”学生毕业的第一年，在分配过程中，就曾出现过广州某单位点名只要同一专业“三年制”学生的情况。
学制的缩短同样也在学生中引起议论。生命科学系硕士二年级学生小李认为，对于不想将来搞科研急于就业的同学来讲，两年确实是赚了时间；而对于有志于从事科研的学生而言，读三年可能更好，“因为两年毕竟时间紧，学业压力大，有些实验要做一年多，院里导师担心两年完成不了任务，而且，如果继续读博，也不会影响，三年功底更扎实，且收费标准不变，不会增加学生负担。”
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