化学化工学院是原中央大学重要的院系之一，最早于1920年就成立化学系，1928年成立了化学工程系，并培养了赵承嘏、恽子强、曾昭抡、赵宗燠、柳大纲、袁翰青、王葆仁、高怡生、黄耀曾、高鸿、胡宏纹、时钧、陈鉴远、嵇汝运、陈荣悌、黄葆同、陈家镛、楼南泉、梁晓天、闵恩泽、朱起鹤、陆婉珍、张存浩院士等一大批科学家，1958年国家高等学校院系调整时，以化学工程系为母体成立了南京化工学院（现南京工业大学）。1988年学校出于学科发展需要，恢复建立了化学化工系，2006年为适应学科建设发展的需要成立了化学化工学院，同时下设化学系、化学工程系、制药工程系和高分子科学与工程系（筹）等四个系。
学院现拥有-“十一五”江苏省级重点学科-“应用化学”，拥有“应用化学”、“材料物理与化学”、“制药工程”、“生物材料与组织工程”4个工学博士点，“化学工程与技术”一级学科硕士点，“化学工程”、“化学工艺”、“应用化学”、“生物化工”、“工业催化”、“材料物理与化学”、“制药工程”、“生物材料与组织工程”等8个工学硕士点，“物理化学”（理科）、“高分子化学与物理”（理科）等2个理学硕士点，“化学工程”、“材料工程”、“生物化工”等3个工程硕士点。2006年全国“化学工程与技术”一级学科评估我院排第20名。学院设立“化学工程与工艺”（精细化工）专业和“制药工程”专业两个本科专业，其中 “化学工程与工艺”专业2006年被评为校级品牌、特色专业，现正在积极申报“化学”大类本科专业（理科）。主办《化工时刊》全国性杂志。
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