吴健雄学院是东南大学优秀人才的培养基地，教学改革的试验基地，管理改革的示范基地。
学院以世界杰出物理学家、东南大学校友吴健雄的名字命名，充分体现了我校对优秀学生的成长充满着激励之意，寄予着殷切希望；2004年11月著名物理学家、诺贝尔物理奖获得者丁肇中先生被东南大学受聘担任名誉院长，东南大学校长兼任学院院长，充分说明了我校领导对优秀人才培养工作的高度重视和关心。
学院依托我校的学科优势和资源优势，努力开展高层次创新人才的培养模式的探索实践。现设有“电子信息类强化班”、“机械动力类强化班”，实施按学科大类培养的“2+2”培养模式，涵盖了我校信息科学与工程、电子科学与工程、自动化、计算机科学与工程、生物科学与工医学程、电气工程、仪器科学与工程、机械工程、能源与环境等9个学科方向。2006年秋以我校建筑学和土木工程两个强势学科为基础，开设了“杨廷宝班”，实施“长学制分流式”的土建类综合创新人才的新模式，由我校建筑学院和土木工程学院共同负责学生培养及教育教学管理工作； 2007年秋新设立了“高等理工实验班”实施“单独招生，独立编班，导师指导，优才优育，特殊培养”的模式，探索和实践新的高层次创新人才培养模式和教育教学模式。
目前，学院在校学生总数550人，其中电子信息类强化班352人、机械动力类强化班104人、高等理工实验班15人由吴健雄学院负责管理，“杨廷宝班” 两届79名学生的教育、教学和日常管理由我校建筑学院、土木工程学院共同负责管理。
吴健雄学院的学生勤奋好学、奋发向上，学院在校学生总体表现为综合素质高，实践能力强，知识、能力、素质全面发展，表现出了良好的创新潜质，得到了社会的好评。近年来，获由团省委、省教育厅、省学联共同主办的2007年度“江苏省十佳青年学生”1人，获“江苏省先进班集体”光荣称号2项，获“江苏省优秀学生干部”光荣称号3人，获“东南大学十大校园骄子”荣誉称号3人，获校“三好生”、“三好生标兵”、“优秀团员”、“优秀学生干部”等荣誉称号有281人次，获得校级先进集体和优秀团支部的光荣称号9项。获省级以上各类学科竞赛奖68项117人次，其中国际大学生数模竞赛一等奖4项、二等奖4项，全国大学生电子设计大赛特等奖1项和一等奖1项，智能车大赛全国二等奖1项，全国大学生英语竞赛全国特等奖1项、二等奖三等奖各1项。2005年新华日报曾报道我院9名学生获国际数模竞赛一等奖的情况。获江苏省本科生优秀毕业设计论文9篇，其中省一等奖5篇，二等奖4篇；获得校级优秀毕业设计论文20余篇；学生在正式刊物上或国际性学术会议上发表学术论文或研究性文章27篇，学生申请发明专利已受理1项，已授权实用新型专利1项；
吴健雄学院还大力支持学生通过参观访问、交换学习和国际会议等形式走出国门进行参观、学习和深造，开阔学生眼界，拓宽学生的知识面和综合能力。自2004年以来，有17名学生分别赴加拿大、日本、法国、美国、德国等国家参加国际学术会议或文化交流活动，尤其是结合“双语物理导论”课程教改实践近三年来学院派出的8位一年级学生在国际学术会议上的表现引起了国内外专家学者的关注和赞赏。《Science》杂志就该课程教改实践在2007年第5834期做了专题报导，在国内外产生了较大影响。
自少年班成立以来，吴健雄学院共为国家培养了1012名各类专业人才，为国家经济建设、以及教育、科技、文化的发展做出了重要的贡献。学院的毕业生发展前景广阔，学生继续深造的比例达80%；许多毕业生已在科技、经济、管理等领域崭露头角，有的毕业生在国际一流的科研机构（如美国AT&T贝尔实验室）从事科学研究，成为相关领域有影响力的专家；有的毕业生在国内外大公司从事新技术、新产品的开发研制的工作，为企业创造了巨大的产值利润；有的毕业生在国内外知名大学从事学术研究和人才培养工作，被聘为“长江学者”特聘教授，成为知名的学者；有的毕业生因其在相关领域的特殊贡献，荣获省级先进工作者等荣誉称号……
吴健雄学院
一方沃土让学生汲取强劲的发展潜力；
一池碧水让学生激起精彩的创造浪花；
一片蓝天让学生发挥杰出的特色才能；
一个品牌让学生与学校引以自豪。
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