南京航空航天大学流体力学学科的发展始于建校之初，在六十年代和七十年代建成了当时国内高校唯一的配套大型风洞设备。1980年本学科成为首批具有硕士和博士学位授予权的学科。1988年被评为国家重点学科。近年来，本学科依托先进的科研条件和雄厚的科研实力，在流体力学现代数值方法与软件开发、非定常流动控制、高超声速空气动力数值模拟与试验研究、飞行器气动力设计技术与风洞试验技术、大型风力机空气动力学等重大关键技术方面的研究中，为我国科学技术和国防科研事业做出了重要的贡献，2002年评为国防科工委重点学科。现为国家重点学科，江苏省重点学科。
通过多年的建设，本学科拥有较完备的科研条件平台，拥有完整的低速、跨音速、超音速、高超音速风洞群，科研条件在全国高校中处于先进水平。
本学科已形成一支以若干中青年著名学者为学术带头人，结构合理的高层次学术队伍。现有教师36人，其中“长江学者”海外特聘教授1名，教授16人，副教授13人；90%的教师具有博士学位，70%以上的教师具有一年以上的海外留学或工作经历。几年来，一批年轻的学术骨干快速成长，7人次入选国家、教育部、国防、江苏省人才培养计划。
本学科承担了包括“973”项目、国防预研、国家和部门基金、国际合作、型号研制等科研任务。“十一五”以来，获得国防科学技术二等奖1项，三等奖2项。年到款科研经费超过2000万。
“十一五”以来，本学科培养出硕士、博士等大批高层次人才，获江苏省优秀博士学位论文1篇，江苏省优秀硕士学位论文1篇，毕业的众多博士、硕士已成为国防科研机构的骨干与中坚力量。
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