吉林大学研究生院建于1984年6月，是经国务院批准的全国22所重点大学首批试办的研究生院之一。1996年3月，经原国家教委批准又成为首批正式建院的研究生院之一。
吉林大学研究生教育起步较早，1949年开始招收研究生班，1952年开始招收三年制研究生，1978年开始培养学位研究生。
1985年10月，经国务院批准，吉林大学成为首批建立博士后科研流动站的单位之一。
根据国务院关于高教管理体制改革和布局结构调整的决定，经教育部批准，2000年6月12日，分别隶属教育部、卫生部、国土资源部、信息产业部的吉林大学、吉林工业大学、白求恩医科大学、长春科技大学、长春邮电学院5所高校合并组建新的吉林大学。2004年原解放军军需大学并入吉林大学。新组建的吉林大学，学位与研究生教育的学科门类更加齐全，覆盖了哲学、经济学、法学、文学、教育学、历史学、理学、工学、医学、农学、管理学、军事学全部十二大学科门类。全校现有一级学科博士学位授权点44个，二级学科博士学位授权点240个，一级学科硕士学位授权点59个，二级学科硕士学位授权点311个，各类专业学位授权点29个。有一级学科国家重点学科4个（覆盖17个二级学科），二级学科国家重点学科15 个，国家重点（培育）学科4个。博士后科研流动站37个。中国科学院和中国工程院院士18人（双聘9人），国务院学位委员会学科评议组成员18人，博士生导师1186人；在校博士生、硕士生2.3万余人。副校长、博士生导师吴振武教授兼任研究生院院长，赵丁选教授任常务副院长，刘娅教授、田文晶教授任副院长；下设学位办公室、研究生培养处、研究生管理处、研究生综合处。
多年来，吉林大学一直把人才培养质量视为学位与研究生教育的生命线。为此，研究生院采取了一系列重要措施：严格审查报考资格；科学制定研究生培养方案；不断更新课程设置；严格学位授予标准；建立健全各项规章制度，严格管理；重视研究生德育教育，加强研究生的思想政治工作等。同时，研究生院还进行了学位与研究生教育方面的改革：优秀硕士生直接攻读博士学位；本--硕连读和硕--博连读等多种培养模式；为企业或行业培养应用型、复合型硕士研究生；招收金融硕士、应用统计硕士、税务硕士、国际商务硕士、保险硕士、资产评估硕士、法律硕士、社会工作硕士、教育硕士、体育硕士、汉语国际教育硕士、应用心理硕士、艺术硕士、翻译硕士、新闻与传播硕士、文物与博物馆硕士、工程硕士、农业推广硕士、公共卫生硕士、护理硕士、药学硕士、工商管理硕士（MBA）、公共管理硕士（MPA）、会计硕士、图书情报硕士、工程管理硕士专业学位研究生；还包括临床医学、口腔医学、兽医硕士及博士专业学位研究生；开展在职人员申请博士、硕士学位等。目前，吉林大学研究生院已经成为学科门类齐全、培养质量较高的我国重要的研究生培养基地。
吉林大学地处吉林省省会长春市。长春素以街道宽阔、树木繁茂、空气清新而著称。一座座高大的建筑物衬托在莽莽林海中，被誉为”森林城市”。夏天，柳暗花明，气候凉爽宜人；冬天，玉树银花，景象奇妙动人，而室内有采暖设备温暖如春。因此，无论是阳春、盛夏、金秋、寒冬，长春都是读书学习、科学研究的好地方。
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