卫生部北京老年医学研究所成立于1985年,是在卫生部北京医院长期老年保健和科研工作基础上建立与发展起来的我国唯一的国家级老年医学研究机构。卫生部北京老年医学研究所与卫生部北京医院实施一体化领导。卫生部北京老年医学研究所下设生物化学研究室、细胞生物学研究室、分子生物学研究室、医学遗传学研究室、免疫学研究室、流行病学研究室、老年保健品功能评价研究室及中心实验室。卫生部老年医学重点实验室、中国疾病预防控制中心老年保健中心和世界卫生组织中国老年卫生研究培训合作中心亦设在研究所内。
卫生部北京老年医学研究所的研究方向是以老年医学为重点,开展老年常见疾病的发病机制、诊断与防治研究以及延缓衰老过程的研究。建所以来坚持“基础研究与临床研究相结合;理论研究与应用研究相结合;科研与开发相结合”的指导方针,以应用基础研究与应用研究为主,重视基础研究,加强开发研究,在老年医学尤其是心脑血管病和糖尿病防治研究等方面取得了较大的成就,先后承担了国家“973”、“863”计划项目;国家“九五”、“十五”、“十一五”攻关项目;国家自然科学基金课题;卫生部、人事部、教育部科研项目;北京市自然科学基金课题;首都医学发展科研基金课题以及WHO与国际老年学会基金等课题。获得了国家科技进步二等奖与三等奖、卫生部科技进步二等奖与三等奖、北京市科技进步二等奖与三等奖、解放军科技进步二等奖与三等奖以及中华医学奖。卫生部北京老年医学研究所已成为国家老年医学研究的重要基地。
1987年卫生部北京老年医学研究所以挂靠中国协和医科大学的形式开始招收硕士研究生,1990年经国务院学位委员会第九次会议批准为老年医学硕士学位授予单位。1993年以挂靠中国协和医科大学的形式开始招收博士研究生,2007年以挂靠北京大学医学部的形式开始招收博士研究生。卫生部北京老年医学研究所已成为老年医学研究人才的培养基地。