系统与控制工程系系统工程学科设有我国高校唯一的航空火控与指挥系统工程专业、作战效能分析专业，是部级重点实验室“航空火力与指挥控制系统”、“211工程”重点学科建设项目“航空武器综合火控系统仿真”的所在地。拥有硕士点、博士点、博士后流动站，以及“航空武器系统研究所”和“中俄联合航空系统效能教学科研中心”。现有教授5人（博士生导师3人），副教授6人；3名实验室编制人员均为高级工程师或高级实验师，教师博士率达到75%。博士、硕士生100余名。
系统工程学科是“十一五”、“211工程”重点学科建设单位、国防科工委重点学科和重点专业建设单位。1981年以来，培养硕士生150余名、博士生35名，毕业学生适应性强，就业面广；完成科研项目近350项，在国内外发表学术论文近550篇，科研成果鉴定28项，获国家级奖2项、省部级奖22项；出版专著、教材20部，获省部级教学成果奖3项；多人获得多项省部级荣誉奖。
本学科已形成了稳定的具有鲜明国防高科技特色和航空特色的研究方向：复杂系统建模、仿真与性能评估；航空电子综合系统及仿真技术；现代火力控制理论；先进控制理论及应用。
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