创建于1955年12月19日,行政隶属中国中医科学院。并于1994年通过国家验收,成为全国首批三级甲等中医医院及全国示范中医医院。医院现占地面积69500平方米,建筑面积74900平方米,医疗用房面积38987平方米,辅助用房面积8399平方米,生活用房面积28268平方米,医院的固定资产达250842353元人民币。目前设有全国中医心血管病、老年病、血液病医疗中心;中医呼吸科、消化科、肾病科、神经I科、神经II科、肿瘤科、风湿免疫科、内分泌科、肝病科、外科、周围血管病科、男科、肛肠科、妇科、儿科、骨科、耳鼻喉科、口腔科、康复医学科、针灸科、皮肤科、气功推拿科、急诊科、眼科、感染疾病科等临床科室,超声科、放射科、检验科、药剂科等辅助科室。中国中医科学院西苑医院老年病科、心血管科、血液病科均为国家中医药管理局“十五”重点专科项目建设单位。
中国中医科学院西苑医院是新中国成立后由政府建设的第一所大型中医院,是中国中医科学院的第一临床医药研究所、老年医学研究所、临床药理研究所,是全国GCP中心,是一所集医、科、教、康复保健为一体的大型综合性三级甲等中医医院、全国示范中医医院和北京市基本医疗保险定点医疗机构。西苑医院还是世界卫生组织传统医学合作中心之一和卫生部国际紧急救援中心网络医院,是全国中医心血管病、血液病、老年病专科医疗中心和全国中医内科心血管学、血液学、中药药理学重点学科建设单位以及呼吸等北京市重点学科所在单位;是全国中西医结合学会神经内科、血液学专业委员会、世界中医药学会联合会耳鼻喉口腔科专业委员会、中国药膳研究会等学会和《中国中西医结合杂志》的挂靠单位,是卫生部“西学中班”的培训基地。