厦门大学医学院于1996年10月11日经国家教育部批准正式成立，是一所由厦门市人民政府和厦门大学联办、并得到海外华人、华侨资助的学院。她位于风光旖旎、风景秀丽，气候宜人的“海上花园”厦门市东南海湾，现任院长为教育部“长江学者”特聘教授刘祖国博士，党委书记为邵鹏飞同志。
医学院依托厦门大学学科门类齐全、师资力量雄厚的优势办学。学院现有教职工近200人，其中院士4人，教育部“长江学者”特聘教授1人，“闽江学者”特聘教授3人，硕、博士生导师200余人，教授、副教授近70人，博士60余人，以及近400名副高以上职称的临床教学科研师资队伍。
医学院下设基础医学部、临床医学系、预防医学系、药学系、中医学系、眼视光系、护理系、基础医学实验教学中心、中医药研究中心、卫生经济与政策研究中心、眼科研究所、消化疾病研究所、器官移植研究所、福建省抗癌研究中心、福建省实验教学示范中心和福建省药学实验教学示范中心等教学科研机构；拥有附属中山医院、附属东南医院、附属厦门眼科中心、附属东方医院和附属第一医院等5家三级甲等附属医院和30余家教学实习医院与基地。
学院设有临床医学、预防医学、中医学、药学、护理学等5个本科专业；生理学、微生物学、药物化学、药理学、外科学、内科学、肿瘤学7个硕士学位授予权和生理学博士点。现有在校硕、博研究生300余人、本科生1500余人，留学生近200人，在籍海外函授生2000余人。
近年来，医学院科研成果显著，承担国家“863”重大科研项目、国家自然科学基金、以及省、部级科研项目数十项，多项成果获省部级科技进步奖和国家发明专利，在SCI及国家、省部级重要刊物发表论文数百篇。
学院秉承厦门大学“自强不息，止于至善”的校训，以培养“厚基础、强能力、高水平”的综合性人才为办学目的，充分发挥厦门大学师资力量雄厚的优势，云集了赵玉芬、陈洪铎、张运、曾益新院士等一批国内外知名专家学者，学科梯队初具规模。学院教学科研仪器设备先进，设备固定资产总值达近亿万元，占地面积3600多亩的医学及生命科学新校区正在紧锣密鼓的建设之中。
目前，医学院正按照厦门大学的办学要求，昂首阔步朝着“世界知名的高水平研究型大学”的奋斗目标迈进。
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