厦门大学工科的建设可以追溯到学校创立初期，早在1922年7月，就设立工学部。1937年厦门大学改为国立，以后相继创办土木工程、电机工程、机械工程、航空工程四个系，并组合成工学院。在抗日战争和解放战争时期，工学院的毕业生遍及海内外，为反对日军侵略和人民解放战争做出了突出贡献。解放前夕，工学院的学生超过全校学生总数的三分之一。解放初期，国家对全国高校进行院系调整，厦门大学不再保留工科。改革开放以后，随着国家和地方经济建设对工程技术人才的迫切需要，厦门大学于1985年10月成立技术科学学院，1994年改名为工学院。1999年7月由工学院的电子工程系、自动化系、计算机科学系组建了计算机与信息工程学院，2004年11月更名为信息科学与技术学院。
信息科学与技术学院现下设计算机科学系、自动化系、电子工程系、通信工程系、智能科学与技术系5个系和电子信息研究所、智能图像与信息系统研究室、人口资源环境与地理信息系统研究中心、语言技术中心、系统与控制研究中心5个校内研究机构，集成电路设计与测试分析、 智能信息技术2个福建省高校重点实验室，以及福建省批准设立的福建省集成电路设计工程技术中心，水声通信与海洋信息技术教育部重点实验室。此外学院内部按二级学科共设立13个院内研究所，主要从事信息科学领域的应用基础研究和技术开发研究。
学院现有教职工226名，其中专职教师142人，实验技术人员62人。博士生导师13人；教授30人，副教授41人；全院高级职务人数为83人。具有博士学位的教师56人，硕士学位74人，35岁以下的教师占40%。师资队伍年轻化，学历与学缘结构优化，形成一支朝气蓬勃、富有潜力的教学科研团队。
目前学院有5个二级学科博士点：通信与信息系统、控制理论与控制工程、人工智能基础、电路与系统、系统工程；4个一级学科硕士点：电子科学与技术、信息与通信工程、控制科学与工程、计算机科学与技术；1个二级学科硕士点：光学工程；4个工程硕士点：电子与通信工程，集成电路，控制工程，计算机技术；5个本科专业：计算机科学与技术、电子信息工程、通信工程、自动化、智能科学与技术，3个省级重点学科：信息通信与信息系统、控制理论与控制工程、计算机软件与理论。
目前在校的本科生1961人，硕士研究生653人，博士研究生106人。学院深化教学改革，优化课程结构，重视学生综合素质的培养，注重培养学生创新能力和实际工作能力，已连续多年在国内外各种学生设计大赛中屡屡得奖。每年本科毕业生就业率均在95%以上，研究生就业率接近100%。多次被评为厦门大学毕业生就业先进单位。
目前学院承担着“十五”“211”重点建设项目—“电子信息技术”项目，在立体通信、智能信息处理、先进控制与制造业信息化、集成电路设计等方面开展研究。学院正承担着“985”二期平台建设项目，建设经费达5500万元人民币。同时，学院还承担一大批国家及地方纵向和横向科研课题。
经过学院师生员工的共同努力，特别是学校近年来加强了对工科的支持力度，信息科学与技术学院已成长为一个几乎覆盖整个信息学科，有一定人才培养规模，师资队伍知识、学历、学缘、年龄结构较为优化的学院；培养了一大批信息科学与技术的高级专门人才，同时已初步形成一些有特色的研究方向，并致力于为地区经济建设的服务。
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