南京农业大学作物遗传育种学科历史悠久、基础雄厚，教学和科研实力强，其总体水平一直居国内同类学科先进行列，某些方面居国内领先地位、达国际先进水平。本学科1981年被批准为我国第一批农学博士学位授予点；1989年被批准为国家重点学科；1990年被批准为全国首批农学博士后流动站；在全国“农科学位点与研究生教育质量评估”中两次均在同类学科中排名第一；1994年被江苏省教委评为“优秀学科梯队”；1998年被列为国家“211工程”重点建设学科；1999年被批准设立“长江学者奖励计划”特聘教授岗位。本学科点设立有“作物遗传与种质创新国家重点实验室”、国家大豆改良中心、教育部杂交棉创制工程中心及江苏省植物基因工程中心。学科现有专职教学科研人员43名，其中中国工程院院士2名、“长江学者奖励计划”特聘教授2名、国家杰出青年科学基金获得者2名、海外杰出青年科学基金合作者1名、何梁何利基金科学与技术进步奖获得者2名、首批入选教育部长江学者和创新团队发展计划、教育部跨（新）世纪优秀人才培养计划获得者6名，国务院学位委员会学科评议组成员2名。专职教学科研人员中，教授22名、副教授13名、博士生导师18名、硕士生导师33名。承担“973”、“863”、国家自然科学基金、省（部）级和国际合作等课题，科研经费充足。针对水稻、小麦、棉花、大豆等主要农作物，主要从事以下10个方向的研究：①植物育种的原理和方法，②植物遗传资源的研究和利用，③植物细胞遗传与育种，④植物数量遗传与育种，⑤植物分子遗传与育种，⑥植物基因组学研究与分子育种，⑦植物基因工程、细胞工程，⑧种子科学与技术，⑨生物信息学，⑩种质基因组学。导师队伍：盖钧镒院士：分子数量遗传学，大豆种质资源与育种；/刘大钧院士：外源基因在植物育种中的利用；/张天真教授：基因组学、分子遗传学、分子设计育种；/ 陈佩度教授：植物细胞与基因工程；/ 万建民教授：水稻遗传育种，植物分子育种，植物基因工程；/ 马正强教授：基于基因组分析的作物改良研究；/翟虎渠教授：植物数量遗传与育种，水稻分子育种； /张红生教授：植物遗传资源的研究和利用，植物分子遗传与育种；/江玲教授：水稻遗传育种；/杨世湖教授：植物基因工程与育种利用，植物细胞工程；/洪德林教授：植物杂种优势的理论与利用，种子科学与技术；/王秀娥教授：分子细胞遗传学，植物分子育种；/郭旺珍教授：基因组学、分子遗传学与分子设计育种、生物信息学；/周宝良教授：分子细胞遗传、种质基因组学；/唐灿明教授：植物育种的原理和方法；/喻德跃教授：植物基因工程， 植物分子遗传与育种；/章元明教授：统计基因组学，生物信息学；/智海剑教授：大豆遗传育种；/邢邯教授：大豆遗传育种；/麻浩教授：植物遗传资源的研究和利用，植物分子遗传与育种； /王建飞副教授 植物分子遗传与育种； /亓增军副教授：植物分子细胞遗传与育种；/王凯副教授：分子细胞遗传学；/吕慧能副教授：植物细胞与基因工程；/杨守萍副教授：分子细胞遗传学；/管荣展副教授：油菜遗传育种；/ 赵团结副教授：植物遗传资源的研究和利用植物细胞遗传与育种；黄骥副教授：植物分子遗传与育种/曹爱忠副教授：植物细胞与基因工程/张文伟副教授：水稻遗传育种/张政值副教授：基于基因组分析的作物改良研究/刘玲珑副教授：水稻遗传育种/戚存扣研究员：油菜遗传育种；/ 张海洋研究员：芝麻遗传育种；/ 王才林研究员：水稻遗传育种；/ 吕川根研究员：水稻遗传育种；/ 许为刚研究员：小麦遗传育种；/ 马鸿翔研究员：植物分子育种；/ 张学勇研究员：种质资源的发掘、创新与利用；/陈旭升研究员：棉花遗传育种； /沈新莲副研究员：棉花遗传育种。
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