上海海洋大学海洋科学学院始创于1912年。设有海洋渔业系、渔业资源系、海洋环境系和海洋信息工程系,建有大洋渔业资源可持续开发省部共建教育部重点实验室、大洋生物资源开发和利用上海市高校重点实验室、中美海洋遥感及渔业信息研究中心、农业部远洋渔业培训中心、全球海上搜救和安全系统(GMDSS)摸拟等中外合作和省部级科研平台和培训机构,以及远洋渔业研究所、海洋法律与政策研究所等校级特色科研平台和实验室,拥有中国渔业协会远洋渔业分会鱿钓技术组、金枪鱼技术组、大型中层拖网等全国性技术咨询和服务机构。现有1个农业部重点学科,1个上海市重点学科,1个上海市教委重点学科,1个上海市教委海洋生物资源与环境创新平台和1个上海市教育高地。拥有捕捞学、渔业资源博士后流动站,捕捞学、渔业资源、渔业环境保护与治理3个博士点,捕捞学、渔业资源、环境科学、渔业环境保护与治理4个硕士点,海洋渔业科学与技术、农业资源与环境、环境工程、海洋技术、海洋科学、海洋管理等6个本科专业,其中海洋渔业科学与技术专业为国家管理专业2007年被教育部评为特色专业。捕捞学为农业部和上海市重点学科。
2009年,学院现有在职教工69名,教授15名,副教授13名。享有国家政府津贴4人,国务院学位委员会学科评议组成员2人,国家级有突出贡献中青年专家1人,省部级有突出贡献中青年专家2人,农业部第七届科技委成员2人,教育部本科教学指导委员会成员2人,教育部新世纪优秀人才1人。上海市科委启明星1人,上海市教委曙光学者2人。许多校友已成为所在部门的领导和科研骨干。在读本科生929名,博士、硕士研究生173名。
曾获国家级教学成果一等、二等奖,上海市教学成果特等奖、一等奖,国家级科技进步二、三等奖,农业部科技进步一等、二等奖,教育部科技进步二等奖,上海市科技进步一、二等奖,国家海洋局科技创新二等奖,中国水产科学院科技进步二等奖,上海市产学研工程一等奖等奖项近20项。