物理科学与技术学院成立于2008年3月。前身是内蒙古大学物理学系。内蒙古大学物理学系创建于1957年，是内蒙古大学建校成立的最早的系之一。1999年10月，由数学系、物理学系、电子工程系组建成理工学院。2008年3月，理工学院机构调整，成立物理科学与技术学院。