石河子大学医学院前身是中国人民解放军第一兵团卫生学校,1949年建校于甘肃天水，同年10月随军进疆。和着共和国前进的步伐不断发展壮大，先后经历了新疆军区卫校、新疆生产建设兵团医学专科学校、兵团医学院、石河子医学院、石河子大学医学院几个发展阶段。62年来，受到了各级领导的高度重视与关心，成为一所 “211工程”重点建设大学和国家西部重点建设大学下，具有明显地域特色和优势的医学院校。
    石河子大学医学院始终坚持“立足兵团、服务新疆、面向全国、辐射中亚”的办学定位，把培养适应少数民族地区经济社会发展需要的高素质医学人才作为根本任务，稳步发展本科教育，大力发展研究生教育，积极推进留学生教育，构建了“多样化、高素质、强应用、重创新”的人才培养体系。先后为国家培养各级各类医药卫生技术人才1.8万名，为地方和国家医药卫生事业的发展作出了贡献。
    石河子大学医学院目前设有临床医学系、基础医学系、护理系、预防医学系、口腔医学系、医学检验系、医学影像系、麻醉学系8个系；开设临床医学、护理学、预防医学、口腔医学、医学影像学、医学检验等6个本科专业，其中临床医学为国家级特色专业。学院拥有4所附属医院（直属医院1所，非直属医院3所），1所临床学院，22所教学、实习医院，其中三甲医院10所。学院现有省、部共建重点实验室1个，自治区和兵团质控中心2个，自治区重点学科3个；病理学与病理生理学、生物化学与分子生物学、生理学、人体解剖与组织胚胎学、流行病与卫生统计学、社会医学与卫生事业管理、免疫学、外科学、内科学、护理学、妇产科学、眼科学、肿瘤学、麻醉学14个硕士学位授予点；护理学一级学科硕士专业学位授予权和基础医学、临床医学一级学科硕士学位授予权刚刚获得批准。
    石河子大学医学院现有专、兼职教师570人，其中“全国优秀科技工作者”及“十佳全国优秀科技工作者提名奖”1人，国家人事部、农业部评为有突出贡献的中青年专家10人，享受政府特殊津贴专家34人；教授49人，副教授95人，讲师179人；博士42人，在读博士53人，硕士134人；硕士生导师40人，兼职博士生导师12人。学院目前在校各层次学生4000余人，其中本科学生2838余名，研究生606人，留学生62人。
    石河子大学医学院注重科技创新工作，近3年来，学院共承担科研项目110余项，科研经费达到2700余万元，其中国家支撑计划项目1项， 973预研项目2项，国际合作项目4项，国家自然科学基金项目累计31项；获省（部）级以上奖励20余项，其中兵团科技进步奖18项，世界首报人类染色体异常核型2例；发表学术论文530余篇，其中SCI收录16篇，核心期刊210余篇。主办学术期刊《农垦医学》（双月刊），国内外公开发行，至今共出版78期，发行总量7.2万册。
    石河子大学医学院广泛开展对外交流与合作，先后与北京大学医学部、华中科技大学同济医学院、武汉大学医学院、浙江大学医学院等国内知名医科院校建立了校际交流合作关系。中国医学科学院、国家人类基因组北方研究中心（CHGB）、巴基斯坦AYUB大学医学院、日本京都大学医学部、美国俄勒冈健康科技大学、澳大利亚癌症理事会等国内外医学院校200余名专家、学者先后来学院考察、访问，开展学术、科研合作。
    乘着西部大开发和新疆跨越式发展的春风，石河子大学医学院将抓住机遇，充分发挥综合性大学学科融合、文理渗透的优势，为边疆的长治久安和医疗卫生事业的发展作出应尽的贡献。