四川农业大学动物医学院办学历史悠久，创办于1912年，学院历经畜牧兽医组、兽医系、畜牧兽医系和动物科技学院等不同发展阶段，经过近百年的发展与演变，2007年7月经院系调整组建成立动物医学院。

学院现有基础医学系、预防医学系、临床医学系、药学系和生物工程系5个教学机构和1个校内教学医院；办学层次齐全，具有培养博士、硕士、本科、成教网络教育与自考等不同办学层次的能力；现有动物医学、药学、生物工程、生物医学工程、动植物检疫（动物检疫方向）、制药工程和药物制剂等7个本科专业；人才培养具有一定规模，现有在校学生2375人，其中本科生2110人，硕士生273人，博士生67人；近年来毕业学生就业率均在90％以上，毕业学生普遍受到了用人单位的充分肯定和好评。

学院师资力量雄厚、学科队伍结构合理、科研成果显著：现有在职教职工68人，教授11人、副教授27人。其中博士生导师8人，硕士生导师27人；新世纪国家“百千万人才工程”国家级人选1人；教育部新世纪优秀人才支持计划2人；四川省学术和技术带头人7人，学术和技术带头人后备人选4人；四川省有突出贡献的优秀专家3人；享受国务院政府特殊津贴专家5人；校学术骨干10人。拥有1个兽医学博士后流动站，1个兽医学一级学科博士学位授权点，7个二级学科博士（硕士）学位授权点（即基础兽医学、预防兽医学、临床兽医学、实验动物兽医学、兽医生物工程、兽医病理学和兽医公共卫生）；1个国家级重点培育学科（预防兽医学），2个省级重点实验室（动物疫病与人类健康四川省重点实验室和动物生物技术中心四川省高校重点实验室）。“动物疫病监测与控制”为我校“211工程”“九五”、“十五”、“十一五”重点建设学科。近年来共获国家科技进步二等奖1项，四川省科技进步一等奖3项、二等奖2项、三等奖3项；获国家二类新兽药证书1个。2006年学院被中国畜牧兽医学会评为“感动中国畜牧兽医科技创新领军院所”。