西安交通大学高等教育研究所的前身是高等教育研究室，始建于1984年10月，1987年6月扩建为研究所。范效良研究员、朱继洲教授、张发荣研究员等先后担任高等教育研究所的领导职务，现任所长为陆根书教授。高等教育研究所着重研究我国高等工程教育和我校改革中的一些重要的理论与实际问题。经过近20年的发展，在教育经济与管理研究、大学学习学研究、高等教育史（尤其是西安交通大学校史研究）、大学生心理研究方面形成了自己的特色与优势。
998年经陕西省学位办批准，高等教育研究所设立了“高等教育学”硕士点，下设“学位与研究生教育”、“高等工程教育管理”、“教育经济学”、“国防教育”等研究方向。该硕士点自设立以来，一直呈现蓬勃发展的良好势头，生源质量不断提高。2004年经教育部批准，与学校军事教研室合作开办“高等教育学（国防教育）”专业硕士学位点，为普通高等学校培养国防教育师资。除了开办“高等教育学”硕士点，高等教育研究所还与我校其他有关单位联合开展“职业教育学”、“教育技术学”等硕士点的建设工作。
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