生物医学信息工程教育部重点实验室是2000年经教育部批准，在原世行贷款建设项目——现代医学电子技术及仪器国家专业实验室的基础上组建。实验室依托于西安交通大学，现任实验室主任为万明习教授，学术委员会主任为俞梦孙院士。
实验室的主要研究方向为：
（1）医学信息工程与仪器；
（2）生物医学超声；
（3）心脏电生理与心脏起搏；
（4）计算生物信息学及应用技术。
实验室现有固定人员34人，其中教授18人（博士生导师16人），副教授10人，具有博士学位的占70%。研究人员中，有国家杰出青年基金获得者2人、国家有突出贡献中青年专家2人、长江学者特聘教授1人。
实验室现有面积4000平方米，相对集中。现有设备800多台套，价值3500多万元，其中30万元以上大型设备20台套。
2000年以来，实验室完成和承担科研项目114项，其中，“973”、“863”和国家重点科技攻关项目8项、国家自然科学基金37项。获得省部级奖4项，发明专利9项。在国内外重要学术期刊上发表论文452篇，SCI、EI收录160余篇。
实验室平均每年招收博士后2名，博士研究生25名，硕士研究生50名。并接受国内外访问学者和外国留学生来实验。
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