训练部是学校教育训练工作的主管机关，在学校党委和校首长的领导下，以新时期军事战略方针为依据，坚持正确的办学方向，落实国家的教育方针，科学制定教育训练工作发展规划，合理提出建设目标，推动学校教育训练工作又好又快地发展。
训练部负责管理全校的教学工作，制定学科专业建设规划、人才培养方案和课程标准，组织各项教学活动，抓好教学质量控制，组织教育科学研究、教学改革和教学成果的评审、推荐工作；负责组织各类教学、医疗、科研用器材、物资的采购、供应和管理，卫生装备的请领、发放，指导、检查附属医院的药材管理工作；负责管理附属医院的医疗工作，抓好卫生战备工作，组织医德医风监评和医政工作，不断提高医疗服务质量；负责任职教育培训、青年师资培养和函授教育工作，提高各类培训的层次和质量；负责学校教育训练基础设施的规划与建设，搭建培养高层次、高质量医学科学人才的平台；负责学校公共服务体系的建设与运转，为学校教学、医疗、科研工作提供良好的保障。
训练部机关下设：校办室、教务处、教保处、临床管理处、函授处、院校协作中心。
所属单位：图书馆、教育技术中心、实验动物中心、网络中心、医学教育研究室、出版社。
主要任务：
1、统筹全校的教学工作。论证专业设置，制订人才培养方案、课程标准并认真组织实施，管理教学运转，稳定教学秩序，抓好教风、学风、考风建设，组织教材的编审、出版、订购工作，组织教学质量检查，规划教学基本建设，组织开展教学改革，负责学籍管理和学历工作，参与组织招生工作，参与教员和教学管理干部队伍建设和技术资格评定工作，负责优秀教员和优秀教育工作者的评审工作。
2、管理全校的教学保障工作。制定学校教学保障规划和年度计划并组织实施，负责学校教育训练经费及专项建设经费的预算、分配与使用，管理学校仪器、设备、试剂等的招标、采购工作，组织教学、医疗、科研用器材、物资的供应和管理工作，负责管理全校的药政、计量工作。
3、负责全校的临床管理工作。指导各附属医院加强科学管理，统筹安排临床、护理工作，检查、监督临床医疗规章制度、医护技术操作常规的执行情况，抓好临床特色建设，督促各医院开展临床新业务、新技术，指导医院重大业务活动和专科中心建设，组织医疗卫生战备工作。
4、组织函授和任职教育培训工作。负责各类任职教育培训班的教学计划、组织、管理工作，管理青年师资的培训、考核工作，组织军队在职干部的函授招生、面授、学籍管理工作，负责全校继续医学教育项目的申报和组织管理工作。
5、做好西安地区军队院校协作工作。配合协作单位贯彻落实军委、总部的有关方针、政策和指示，组织协作单位之间的联系与合作，搜集和传递教育训练相关信息，交流和推广教育训练成果及经验，协调教育资源的开发和利用，开展联合教学、共育人才等协作活动。
6、领导直属单位的全面工作。
7、管理本部人员的思想政治教育和行政管理工作。
8、完成上级赋予的其他工作任务
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