原子与分子物理是物理与电子工程学院具有较强优势的学科之一，近年来取得了长足的发展。1998年由国务院学位委员会批准设立硕士点，并于2003年设立博士点，目前是省级重点学科。研究所在原子结构与光谱、激光场中的原子分子物理、复杂分子及团簇的结构与性能、闪电光谱、基于加速器的原子分子物理等研究方面已形成了具有特色、
在国内外有一定影响的学科体系。学术队伍中目前有教授4人、研究员1人，已逐步形成了年富力强、结构合理、富有创新精神的学科梯队。博士生导师董晨钟教授、周效信教授和马新文研究员等都在各自的研究领域取得了较高水平的研究成果。近几年来，研究所成员已发表科研论文百余篇，其中在Phys．Rev．Lett，Phys．Rev．A，J．Phys．B以及J．Euro．Phys．D 等国际核心期刊（SCI收录）上发表论文几十篇，研究成果获得省高校科技进步二等奖2项，省科技进步二、三等奖4项。已完成国家自然科学基金项目5项；目前正在承担的国家自然科学基金等各类项目9项，在研基金百余万元．研究所建有原子与分子光谱实验室，拥有红宝石激光器、YAG激光器及染料激光器和高分辨率的2米光栅谱仪、真空紫外谱仪、双光栅单色仪、光学多道分析仪等检测设备，开展了激光等离子体光谱和分子光谱方面的研究工作。研究所采用多种形式的学术交流，经常性邀请国内外专家学者来进行合作交流并做学术报告，并与许多国内外科研院所建立了合作关系。研究所曾成功举办了“全国原子与分子物理学术会议”、“原子分子物理前沿专题兰州研讨会”和“中日等离子体中原子分子物理过程研讨会”等国内、国际会议。
目前与我所有合作研究的科研机构主要有德国Kassel大学，德国重离子加速器国家实验室（GSI），爱尔兰都柏林大学，立陶宛维尔纽斯大学，日本北里大学，美国堪萨斯州立大学，美国德克萨斯州A&M大学，北京应用物理与计算数学研究所，中科院兰州近代物理研究所，中科院武汉数学与物理研究所，中科院寒区旱区环境与工程研究所等。
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