临床兽医学为二级学科，由兽医内科与诊断学、兽医外产科学、中兽医学3个三级学科和兽医院组成，为临床兽医学博士学位与硕士学位授予点。现为南京农业大学校级重点学科。
　　
　　主要研究方向：兽医临床病理学、小动物疾病学、畜禽营养代谢病、家畜中毒病及其与畜产品安全、动物营养与免疫、畜禽骨骼生物学、实验外科、动物生殖生物学与生殖疾病控制、中兽医学与中西医结合等。
　　
　　现有教授5名，副教授3名，博士生导师5名，硕士生导师7名。多数均有博士学位，有一支年龄结构合理、在国内有较高影响的学术梯队。本学科近年来主持国家和部省级课题25项，经费数百万元；获多项部省级科技进步奖，转让科研成果5项；在国内外核心期刊发表论文近300篇，其中SCI收录20篇；出版学术专著15部，主编教材8部；在“畜禽营养代谢病”、“畜禽骨骼生物学”、“中西兽医结合”等研究方向具有鲜明特色，其研究成果为国内同行所瞩目和公认。先后派出多名教师出国进修，邀请多名国外著名专家来校讲学和合作科研。长期举办“国际针灸班”，接受国外留学人员。