食品科学与工程专业（原畜产品加工专业）始建于l952年，是恢复高考后首批享有硕士、博士学位授予权的学科。经过五十多年的建设，学院已成为教学、科研、生产三位一体的人才培养基地。是全国各类院校中能够培养食品科学博士的少有几所大学之一。尤其在乳品科学研究方面，居全国领先地位。该专业为食品营养与安全、畜产品加工、粮油食品加工和园产品加工领域培养专业技术人才，同时为以上领域输送研究生。下设食品营养与安全、畜产品加工、粮油食品加工和园产品加工四个专业方向。

　　（1）食品营养与安全专业方向：培养的是以食品科学及技术和营养学、卫生学以及食品分析化学为基础，具体研究食品企业在产品研发、产品质量控制方面问题的高级专门人才。

　　（2）畜产品加工专业方向：培养具有乳品、肉品和蛋品专业技术知识和能力，能从事畜产品科学研究、新产品开发、深加工和食品品质检测等方面的工作的高级专门技术人才。

　　（3）粮油食品加工专业方向：培养具有生化、食品化学、食品工程和粮油加工及检验等技术知识，在粮油、淀粉和植物蛋白等领域从事生产技术、品质控制、产品开发、科学研究和工程设计工作的高级技术人才。

　　（4）园产品加工专业方向：培养具有食品生化、食品化学、食品工程、园产品加工和果蔬贮藏与加工检验等技术知识，在果蔬、饮料等领域从事生产技术管理、品质控制、产品开发、科学研究和工程设计等方面的高级专门技术人才。

　　食品科学与工程专业（学科）是黑龙江省重点学科、黑龙江省重点专业，拥有乳品科学国家教育部重点实验室；生物乳业黑龙江省重点实验室，博士后流动站。有三个研究生专业：食品科学专业、农产品加工与贮藏专业和粮食、油脂及植物蛋白工程专业。其中食品科学专业具有博士、硕士学位授予权；农产品加工与贮藏专业具有硕士学位授予权。目前该专业有博士生导师8名，硕士生导师22名。