皖南医学院医学二系于2007年11月正式成立，由医学技术系和生物医学工程系整合建立，医学技术系前身是麻醉系。
现有麻醉学、医学影像学2个本科专业，麻醉学、影像医学与核医学2个硕士点。下设临床麻醉学与危重病学、医学影像学、超声诊断学、核医学、麻醉与影像设备学5个教研室和麻醉学、医学影像学2个实验中心。现有在校学生1616人，其中麻醉学本科生814人，医学影像学本科生802人。
目前专兼职专业教师和实验教辅共78人，其中硕士生导师10人，高级职称33人，中级职称24人，博士3人、硕士30人。
近2年我系质量工程建设获得突破，其中获1项省级创新实验区（麻醉学复合型人才创新实验区）、1项省级特色专业（麻醉学专业）、1项省级教研成果二等奖、1项省级教坛新秀、3项校级精品课程、6项校级教研课题。
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