学制三年。主要开设课程有英语、计算机应用、医学统计学、科研方法学、文献检索、分子生物学、实验动物学基础、实验针灸学、针灸学专题、经典著作选讲、中医临床基础研究、医学免疫学等课程。要求研究生具有系统、扎实的中医基础理论针灸推拿学科专门知识及技能。熟悉本学科国内外学术发展动态，掌握一定的现代科学技术和研究方法，具备独立从事本学科科研和教学能力，能独立运用针灸、推拿和气功处理临床常见病，具有较高的英语水平。研究生在读期间跟从导师从事教学、临床医疗和科研工作，临床工作要求达到总住院医师水平。研究生毕业可授予医学硕士学位。毕业后能从事临床医疗、教学、科研和医务行政管理工作。