2002年我院“农业机械化工程”硕士点将首次招生，硕士点围绕西部大开发和云南建设“绿色经济强省”的目标形成了有特色的研究方向：1、计算机应用：计算机仿真模拟，计算机辅助设计，计算机管理系统等。2、机电一体化技术：机械制造设备机电一体化，设施农业机电一体化。3、农业机械化及设施：山区设施农业中的小型农业机械，设施农业系统中小型农业动力机械、拖拉机。3、农产品加工工程：云南特色农产品加工工艺及设备，饲料加工工艺及设备。