发酵工程学科是国家教育部在我国建立最早的学科之一，该专业以微生物技术为中心，与基因工程技术、细胞工程、化工工程等相关学科交叉融合，以实现生物工程技术产业化为目的的综合性学科。

　　山东轻工业学院是山东省在工科院校中最早设置发酵工程专业的高等院校，1978年开始招收发酵工程专业本科生，1999年开始招收硕士研究生，已毕业硕士研究生16人，在校人数已达36人。

　　学校领导非常重视发酵工程学科教学、科研队伍的建设，目前从事教学、科研的人员有60多人，其中教授7人，副教授26人，高级实验员6人，讲师15，具有博士学位人员10人，硕士学位人员26人，有12人到国外进行了一年以上的进修或获得硕士以上的学位。

　　发酵工程学科共有实验室面积2800㎡，大型设备80多台套，设备固定资产1000多元，其中高速冷冻离心，全自动发酵罐，微型饮料生产线，CO2超临界萃取设备，高压均质机，布拉本德粉质仪系列，高效毛细管电泳仪，啤酒全自动生产线，气相色谱仪，高效液相色谱仪，红外光谱仪，核酸蛋白质自动检测仪，基因扩增仪（PCR），酶标仪，全自动喷雾干燥器、等离子体元素测定仪等在国内具有先进水平。

　　该学科硕士点下设四个主要研究方向，它们分别是：生物产品分离分析技术、微生物酶技术、工业微生物优良菌株的选育、现代酿酒技术，目前拥有导师12人。

　　近几年共完成上级委托课题22项，与企业合作课题38项，到位科研经费660多万元，为社会创造经济效益5.4亿元，该学科发表科研论文300余篇，其中被SCI、EI、ISTP收录的27篇。出版学术专著、编著、译著22部，其中魏述众编著的《生物化学》已经列为全国发酵工程专业通用教材，获华东地区优秀大学教材二等奖（1999），并被很多院校列为发酵工程专业研究生入学考试指定参考书。科研项目获国家科技奖励二等奖一项，三等奖一项，四等奖二项，山东省科技进步二等奖三项，三等奖三项。