农业环境保护与食品安全学科是于2003年在农业资源利用一级学科的框架内自主设立的新型学科，该学科的设立适应了当前农业资源利用一级学科下各二级学科之间相互渗透和交叉发展的态势，尤其是在融合和依托土壤学与植物营养学基本理论和研究手段的基础上，拓展了二者的研究领域，特别是融合了环境科学的基本理论和研究方法，因此农业环境保护与食品安全作为学科具有鲜明的综合性和交叉性。
农业环境保护与食品安全学科的培养目标是：培养能够从事食品生产与食品安全保证、农业环境保护和被污染环境的修复、安全食品生产、食品安全标准制定和安全检测等领域的高级专业人才。
农业环境保护与食品安全学科的研究领域主要有：
（1）以农业生态系统中的土壤–植物体系为核心，研究肥料（尤其是化肥）和农药，灌溉污水及固体废弃物等进入农业生态系统后，无机和有机有毒化学物质从土壤-作物体系到农产品、农业食品中的迁移规律和动态；
（2）明确农业生态系统的污染物承受力、自净力、预警值和预警机制；利用我国丰富的作物种质资源和野生植物资源，挖掘农业生物的遗传潜力，研究污染物低积累、超积累、高效降解的生物机理；
（3）建立多因素、多界面的污染综合预测模型，制定农药、重金属等污染的快速、准确、简便的测试技术和生态修复综合措施；
（4）能够长期持续生产安全和营养丰富的动、植物产品，在不破坏自然资源和环境的条件下促进人类和动物健康，改善水和大气品质的土壤条件与维持机制。
目前，在农业环境保护与食品安全学科领域，共有教授6名，副教授10名，承担国家攻关、中科院知识创新、国家自然科学基金等课题20余项，总经费超过1000万元，具有很好的研究工作基础。
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