南京农业大学中药学专业（原中药材和药用植物专业）为国家一级学科，是我国部属高等农业院校中的一个新兴特色专业，跨越农学和中药学两大学科，主要培养从事药用植（动）物引种驯化、栽培（饲养）、育种、中药资源研究和持续开发利用，以及中药材质量控制等方面的高级专业人才。
　　
　　自1985年中药专业设置以来，已培养了200多名专科生和210多名本科生，多数学生已成为中药研究、生产或经营企业的业务与技术骨干，特别是在近年国家推行的中药现代化行动和《中药材生产质量管理规范（GAP）》施行过程中，本专业毕业生大多已成为主要的技术中坚。本学科现有教职工12人，其中具博士学位5人，教授5人，副教授2人。目前承担国家、省部级科研项目20多项，其中国家级项目4项，自然科学基金2项。更为重要的是本学科带头人作为国家中药材GAP的起草专家，积极参与了有关GAP的起草和实施工作。因此本学科在国内同行业中处于领先水平。本学科硕士点为2003年新增，设有目前我国部属高等农林院校中唯一的一个中药学一级学科硕士学位授权。本学科真诚希望继续加强与国内外同行间的学术交流与合作，同时热忱欢迎有志于从事中药事业的人士前来报考、攻读硕士学位，为我国的传统瑰宝——中医药事业的发展做出更大的贡献。
　　
　　导师队伍和研究方向：郭巧生教授（药用植物遗传多样性、药用植物（动）物引种驯化、中药材质量监控）；侯喜林教授（中药资源与化学、药用植物种质资源研究与创新）；王恬教授（中药资源研究与利用、中药材质量监控）；王庆亚教授（药用植物遗传多样性）；胡元亮教授（中药资源与化学）；王康才副教授（药用植物栽培与生理）；徐迎春副教授（药用植物栽培与生理）。