1953年，由胡炳蔚、刘明俊教授创建了本校法医学科，1985年，本学科经教育部、公安部、司法部、卫生部、最高人民检察院批准，成为我国第一批法医学系之一，招收本科生、硕士生、同时承担全国法医干部培训任务。1996年成立了我国第一个法医学院。1997年经陕西省政府批准为重点学科和重点实验室，1998年获法医学博士学位授予权。1999年，被批准为卫生部法医学重点实验室（公安部、最高人民法院联合共建），同年，经全国博管会和陕西省博管会批准招收法医学项目博士后。2001年学校批准成立西安交通大学法医中心。
在我国，法医学科是一个新兴的处于发展中的学科。目前本学科有博士生导师4名，教授8名，副教授10名，45岁以下博士学位获得者15名，形成了一支以中青年学者为学术带头人的学科队伍。近五年来，主持国际合作项目、国家“九五”攻关项目、国家自然科学基金、中国科学院创新项目及省部级课题40余项，获省部级科技的、进步奖8项，发表学术论文200余篇，其中SCI收录5篇，主编及参编学术著作30余部，出版教材10余部，有9人参加了4部国家教委规划法医学专业教材编写工作，2位老教授担任副主编，获省级优秀教学成果奖2项。1992年起至今与美国李政道博士、Henry C.Lee及J.T.Stewart合作以来，科研水平明显提高，有力的促进了本学科的发展。
近年来，本学科充分利用生命科学、现代生物学和医学的新理论、新方法、新技术、重构法医学科的研究体系与技术平台，初步形成了法医物证、法医毒理及毒物分析、法医人类学三个主要研究方向。
1.法医物证方向主要开展陈旧骨骼DNA分析技术、人类DNA遗传标记和中华民族基因多态性等方面的研究。着重解决生物证据中个体识别、DNA亲子鉴定、遗骸鉴定等疑难问题，并应用于人类遗传结构分析、组织器官配型、疾病相关基因定位研究和法医生物信息庫构建等领域。其中在RFLP、VNTR、STR、HLA遗传多态性等方面的研究已达国际先进水平。
2.法医毒理及毒物分析方向主要开展生物碱类毒物的鉴定、毒物代谢动力学、毒品依赖及毒品相关死亡等研究，建立了稳定的大鼠、家兔慢性吗啡依赖动物模型。通过对阿片依赖与免疫机能的相关研究，提出免疫内分泌系统的改变是毒品成瘾的重要机制之一，同时建立起了毒品主要成分及其衍生物的快速、准确检测方法。今后本方向将利用体内药物分析技术，从毒代动力学、毒物分子靶细胞浓度分布、毒物分子与膜受体作用强度及作用特性方面，系统研究毒品成瘾与依赖的体内过程和机制，同时为研制开发有效的戒毒药物奠定基础。
3.法医人类学是国际十分活跃的研究领域，主要是运用人类学理论与技术解决无名尸体身源鉴定问题。近年来，本学科首先利用CT及核磁共振(MRI)方法，开展头面部软组织厚度及面部形态等活体测量研究，获得了面部形态及软组织厚度的数据资料，为法医学面貌复原奠定了基础，在法医应用实践中取得了满意效果。今后将利用并校后学科齐全的优势，开展数字化、自动化面貌复原快速成型技术研究，使法医颅骨面貌复原及颅像重合更加科学化、个体化，并在快速、高效、准确鉴定方面有所突破。
与国内同类学科相比，本学科在法医物证、毒理与毒物分析、中华民族基因多态性研究方面已经形成特色和优势，但在学科交叉与渗透以及基础研究与积累方面仍显不足，与世界一流学科相比，主要表现在国际性合作交流少、原始性创新不够。今后5年，将加强与相关学科特别是生命科学、生物信息科学的交叉融合，开展有关SNP、犯罪DNA芯片及毒品依赖、复吸机制的创新性基础研究，提高学科研究水平，培养和造就一批21世纪法医人才，为我国社会主义法制建设服务。
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